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明渠式紫外线消毒原理是一用紫外线光子的高能波段的能量破坏水体中的各种病毒、细菌、病原体的DNA和RNA结构，使其受破坏后丧失生产蛋白质的能力和繁殖能力，从而达到灭菌目的。紫外线的杀过程是一个物理过程，其对微生物的遗传物质DNA或RNA的直接作用几乎不具有限制性，先已知的致病微生物都能在0.1-2秒内被紫外线杀灭，可见紫外线是最广谱的消毒技术之一。
紫外线不会对水体添加任何物质，不会产生任何副产品，具有高效、环保、安全的特点。经紫外线消毒后，不存在二次污染及副产物，出水可回用于农田、林地等灌溉或回注水地下，实现资源化。紫外线分为UVA、UVB和UVC三波段，具有杀菌功能的是UVC，其中波长为253.7nm的紫外线杀菌能力最强，一般对紫外线管的优劣评价只要取决于该波段输出的效能。